斑馬魚幼體高通量圖像采集自動操作系統(tǒng)

VAST BioImager? Platform 

VAST BioImager系統(tǒng)是專門為2-7天幼體斑馬魚的高通量圖像采集而設(shè)計。該系統(tǒng)是在美國麻省理工學(xué)院Yanik實驗室開發(fā)的技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展而來。VAST BioImager在采集圖像之前自動完成斑馬魚幼體裝載、定位、旋轉(zhuǎn)等操作，避免了在進(jìn)行高通量圖像采集時對斑馬魚幼體人工操作的時間損耗和冗長的步驟。同時它也是一個組裝式和可拓展的平臺，能安裝在多種直立復(fù)式顯微鏡或者立體顯微鏡上進(jìn)行高分辨率、細(xì)胞水平上的圖像采集。

型號：VAST BioImager

產(chǎn)品特點：

· 適用于高通量&高內(nèi)涵篩選

· 可安裝在多種直立復(fù)式顯微鏡或者立體顯微鏡上

· 可安裝在熒光顯微鏡上進(jìn)行熒光圖像采集

· 配合高階分析軟件，可實現(xiàn)對斑馬魚的高精度定位和高分辨率成像

· 可選配LP Sampler自動加樣器，可實現(xiàn)從96孔板中取樣，傳送斑馬魚幼體到VAST系統(tǒng)進(jìn)行圖像采集

主要功能：

· 專為模式生物研究而設(shè)是斑馬魚研究的有力工具

· 自動處理圖像采集前斑馬魚幼體的各種操作

· 避免人工操作的時間損耗和冗長的步驟

· 在軟件上點擊“Load one Fish”，VAST就會裝載好一個斑馬魚幼體

· 系統(tǒng)可將斑馬魚幼體進(jìn)行360°旋轉(zhuǎn)定位，從側(cè)面、背面或者其他方向進(jìn)行圖像采集

高分辨率顯微鏡載物臺和安裝套件

VAST配合實驗室的顯微鏡一起使用，一旦使用機載攝像頭定位幼蟲，VAST內(nèi)部光源就會關(guān)閉，并且可以使用顯微鏡的光學(xué)器件和攝像頭捕獲高分辨率圖像；

在配備熒光功能的顯微鏡上安裝 VAST 可以收集熒光圖像；

多角度成像

將斑馬魚幼體進(jìn)行360°旋轉(zhuǎn)定位，操作者可根據(jù)自己的意愿選擇方向，側(cè)面、背面或者其他方向進(jìn)行圖像采集

高階版 VAStomography? 軟件（選配）

能夠在幾分鐘內(nèi)生成3D光學(xué)投影斷層掃描 (OPT)
選定感興趣區(qū)域的體積、形狀和位置數(shù)據(jù)集
使用 VolView/ParaView 進(jìn)行 3D 可視化
使用 MATLAB/Python 進(jìn)行數(shù)據(jù)處理

從用 Col2-H2a-mCherry 標(biāo)記的 4 dpf 斑馬魚幼蟲的熒光圖像構(gòu)建斷層掃描

A 腹面觀，B 側(cè)視圖，C 用VASTomography 軟件對同一條魚進(jìn)行3D斷層掃描

手動加樣器

手持式流通式移液器通過單擊按鈕，將斑馬魚裝載到 VAST中

LP Sampler自動進(jìn)樣器

能夠?qū)崿F(xiàn)對多孔板樣品的自動化加樣

完整的圖像采集系統(tǒng)

VAST斑馬魚高通量圖像采集系統(tǒng)可配合LP Sampler組成一套更加完整的高通量拍照平臺

能夠?qū)崿F(xiàn)從多孔板自動進(jìn)樣到顯微鏡成像平臺

VAST BioImager的部分文章：

·Nature Methods, 2010, 7 600-601 and 634-636, Carlos Pardo-Martin, Tsung-Yao Chang, Bryan Kyo Koo, Cody L Gilleland, Steven C Wasserman and Mehmet Fatih Yanik

·Lab Chip, 2012, 12 711-716, Tsung-Yao Chang, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Carolina W?hlby and Mehmet Fatih Yanik

·Nature Communications, 4, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimon, Carolina W?hlby, Mehmet Fatih Yanik